Pastor Petrus Maria Vrancken Pr, pastor kepala di Sittard diangkat menjadi Vikaris Apostolik II pada tanggal 4 Juli 1847 oleh Paus Pius IX. Saat itu beliau berusia 40 tahun. Pertengahan Desember 1847, Mgr Vrancken berangkat ke Indonesia bersama dua imam baru. Kehidupan rohani umat pada waktu itu sangat memprihatinkan. Dari sekitar 600 orang Katolik waktu itu hanya 25 yang menerima komuni suci pada waktu Paskah.

Mgr. Vrancken sangat memperhatikan dan melayani umat. Bukan hanya diantara orang-orang Eropa atau Indo tapi juga masyarakat pribumi. Beliau sempat menulis kepada Prefek Scholten bahwa beliau sedang berfikir untuk mendirikan semacam seminari : "Kita membutuhkan imam-imam pribumi".
Mengingat wilayah yang begitu luas - meliputi seluruh nusantara- sedangkan pekerja sedikit (hanya delapan imam), beliau memandang perlu mendatangkan tenaga misionaris lainnya. Yang pertama datang tujuh suster Ursulin 7 Februari 1856. Disusul dua imam Jesuit pertengahan 1859 dan mulai mengambil alih Paroki Surabaya. Setelah beberapa tahun kesehatannya menurun. Pada tahun 1871, Mgr Vrancken terpaksa pulang ke Belanda untuk berobat. Sebagai Pro-Vikaris ditunjuk Pastor A.C. Claessens Pr. Pada tahun 1874, Mgr Vrancken mengajukan permohonan pengunduran diri dari jabatan beliau sebagai Vikaris Apostolik.